مطالعه سیتوژنتیک گیاهان به‌منظور تعیین سهم هریک از صفات کاریوتیپی در ایجاد تنوع گونه‌های مختلف گیاهان انجام می‌گیرد. برای تهیه نمونه کروموزومی مناسب ۵/۰ سانتی‌متر نوک ریشه را جدا و پس از پیش‌تیمار نوک ریشه، تثبیت، هیدرولیز، رنگ‌آمیزی و اسکواش می‌کنیم و بعد صفحه گسترش متافازی مناسب انتخاب می‌کنیم و در نهایت عکس‌برداری و تهیه کاریوتیپ به‌منظور بررسی مورفولوژی کروموزوم‌ها انجام می‌شود.